【추진체제】 이미 본 대학에는 학장의 리더십을 발휘하는 체제로서 21세기연구교육계획위원회가 설치되어 있다. 그 아래에 「고사기학」연구실시위원회가 설치되어 있고, 연구개발추진 기구의 관리하에 고사기학센터가 본 사업을 추진한다.각 학부와 기관의 역할은 아래와 같다. 우선 『고사기』주석과 직접 연관되는 Ⅰ본문교정・훈독・현대어역 Ⅱ해석사・연구사의 연구［（1）근세 전기・중기 （2）근세 후기 （3）근대 （4）신화학・ 민속학・인류학 （5）전후 역사학의 율령제 이전의 연구］는 문학부・ 법학부・신도문화학부가 담당한다. 그리고 『고사기』와 관련되는 문화자원화의 실태조사와 연구는 경제학부가 담당하여 기업과의 연휴에 활용한다. 『고사기』의 교육 실천연구에 대해서는 인간개발학부(교육실천종합센터)와 교육개발추진기구가 담당한다. 본 사업을 실시함에 있어서 연구기반정비소위원회가 매년도 사업의 진척 상황에 대하여 진행한 자기점검과 평가, 그리고 외부평가위원회의 객관적인 평가를 종합하여 학장에게 보고한다. 학장의 지도하에 「고사기학」연구실시위원회가 수정을 진행한다. 그리고 중간평가(헤이세이30년도)는 수량적 자료로부터 이미 달성한 목표와 재검토해 야 할 목표를 명확히 하고, 차년도 이후의 사업 지침으로 삼는다. 최종년도인 헤이세이 32년도에는 종합적 평가를 진행하여, 장기적 브랜딩 구축을 목적으로 하는 후계사업의 지표로 삼는다. 국내외의 학외 제휴 계획은 아래와 같다. 신사본청종합연구소, 메이지신궁국제신도문 화연구소, 일본문화흥륭재단, 하버드대학라이샤워일본연구소, 중국남개대학, 고사기학회, 신도종교학회, 국제비교신화학회 등과 제휴하여 합동 심포지엄이나 연구회를 개최한다. 교육 실천에 있어서는 신사 관계의 여러 단체와 제휴한다. 그 외에 외부 박물관 등과 제휴하여 기획 전시회・특별 전시회를 개최하고 전시회에 필요한 자료의 상호대차나 공동개최의 강좌 개강을 계획・ 실시한다.